段祺瑞,字芝泉,原名啟端,安徽合肥人也。祖佩,素與劉銘傳善。歷任淮軍銘部團練、統領。祺瑞少隨祖仕,以聰敏見知,頗異之。及祖卒,徒行二月,輾轉投於族叔從德,留作軍幕,專掌司書。
弱冠,考入天津武備學堂,習炮科。居學堂日,攻讀苦勤,學業冠諸生,官費咨送遊學於德國。光緒十六年,歸國。任軍械局隨營教習官。甲午海戰起,隨軍鎮守威海。袁世凱練兵小站,擢陸軍炮隊統帶,武衛右軍各學堂總辦。凡號令行下,處事值機,世凱所倚重之,由是顯名。與馮國璋、王仕珍並稱「北洋三傑」。